近日，国家家养动物种质资源库（简称家养库）分库—特种动物种质资源库、中国农业科学院特产研究所（简称特产所）特种动物遗传资源创新团队通过群体基因组学揭示了梅花鹿在进化和驯化过程中的物种形成和遗传选择特征，为梅花鹿体型差异相关的遗传选择特征提供了新的见解，并为未来的遗传研究和基因组学育种提供了宝贵的基因组资源。相关研究成果发表在《BMC Genomics》上。

群体基因组分析可以重建物种的系统发育关系和种群历史动态，识别物种的基因组选择特征。迄今为止，梅花鹿种群基因组分析的基本方面，如种内分类、进化历史和适应性进化，还没有系统的研究。

该研究以收集的152只中外梅花鹿样本为研究对象，通过全基因组重测序数据分析，阐明梅花鹿的物种划分、群体动态和分化历史以及适应性进化。梅花鹿全基因组、Y染色体和线粒体基因组的分析揭示了大陆梅花鹿和日本梅花鹿谱系之间存在实质性的遗传差异，代表了两个不同的物种。日本梅花鹿被推断经历了“分化-混合-隔离”的进化过程。该研究通过选择性扫描分析确定了4个可能参与梅花鹿体型调节的候选基因（XKR4、NPAS3、CTNNA3和CNTNAP5），两个候选基因（NRP2和EDIL3）在驯化过程中处于选择状态，可能与重要的经济性状（鹿角重量）有关。

特产所助理研究员刘华淼、王天骄、董依萌，北京诺禾致源科技股份有限公司朱波为论文共同第一作者，家养库专家、特产所邢秀梅研究员，日本山形大学玉手英利教授，北京格致博雅生物科技有限公司梁齐齐，北京诺禾致源科技股份有限公司马德为论文共同通讯作者。该研究得到家养库特种动物种质资源库运维项目、中国农业科学院科技创新工程等项目资助。

原文链接：

https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12864-025-11541-w